Lỗi với nền tảng LSF: lsb_init: Không thành công trong cuộc gọi thư viện LSF: Không thể mở tệp lsf.conf

Question

Tôi gặp vấn đề với Nền tảng LSF Tôi không thể bao quanh đầu.

Vì lý do tập lệnh, tôi cần kiểm tra các công việc đang chạy/đang chờ xử lý bằng 'bjobs' (và các b *** khác) bằng tập lệnh perl.

Đối với một số lý do nó đã không làm việc, và tôi đã có thể xem các thông báo lỗi sau:

lsb_init: Failed in an LSF library call: Unable to open file lsf.conf 

Một số nghiên cứu trên Google và trong cuốn hướng dẫn đã không có gì tuyệt vời, tôi đã làm một thử nghiệm nhỏ.

Tài khoản của tôi (tối đa) là quản trị viên LSF. Root cũng là một quản trị viên LSF.

Vì vậy, tôi đã chuyển sang root và cố gắng khởi chạy bjob, nhưng tối đa với 'sudo –u max'. Vui lòng xem các lệnh sau:

hn[~]=> whoami 
max 
hn[~]=> bjobs 
No unfinished job found 
hn[~]=> su 
Password: 
[root@hn max]# whoami 
root 
[root@hn max]# sudo -u max whoami 
max 
[root@hn max]# bjobs 
No unfinished job found 
[root@hn max]# sudo -u max bjobs 
lsb_init: Failed in an LSF library call: Unable to open file lsf.conf 

Làm cách nào để sửa lỗi này?

Answer 1

Theo mặc định, LSF sẽ tìm lsf.conf trong/etc. Nếu nó không có, thì nó sẽ tìm trong thư mục trong biến env LSF_ENVDIR.

sudo có thể đang đặt lại môi trường của bạn. Hãy thử sudo -i hoặc đặt

Defaults !env_reset 

trong tệp sudoers của bạn.

Bạn cũng có thể thử một cái gì đó như thế này

sudo -u max LSF_ENVDIR=$LSF_ENVDIR LSF_SERVERDIR=$LSF_SERVERDIR bjobs 

Answer 2

Đối với bất cứ ai kịch bản xung quanh SSH, hai biến trên phải được thiết lập một cách rõ ràng, hoặc là trên dòng lệnh, như trong:

ssh foo@bar.net 'export LSF_ENVDIR=/path/to/lsf/envdir; export LSF_SERVERDIR=/path/to/lsf/serverdir; bsub ...' 

hoặc trong tệp ~/.ssh/environment tệp (miễn là sshd được định cấu hình với PermitUserEnvironment yes).