Làm cách nào để Sweave một dự án nhiều tệp?

Question

Tôi đang viết luận án của mình trong LaTeX và bởi vì mọi thứ có một chút dài đối với sở thích của tôi, tôi đã chia nó thành nhiều tệp. Hãy gọi cho họ thesis.tex, intro.tex, mat_n_met.tex, rslts.tex và discsn.tex. Tôi đã liên kết intro.tex, mat_n_met.tex, rslts.tex và discsn.tex thông qua thesis.tex với \include{intro} (v.v ...). Tôi cũng đã tạo một tệp riêng biệt được gọi là r_crunching.Rnw (mà tôi chạy qua Sweave) chứa một đoạn chạy tập lệnh R với phân tích dữ liệu và các khối tạo ra kết quả đầu ra pdf của biểu đồ mà tôi đã nhúng qua \includegraphics (ví dụ: rslts.tex). Vẫn theo?

Nếu tôi chạy một Rnw (ví dụ: Tôi đổi tên rslts.tex-rslts.Rnw) mà không cần "một liên kết" với đoạn với kịch bản R, bạn sẽ nhận được một lỗi Sweave() nói tham chiếu trong \Sexpr{} không tồn tại. Có cách nào, mà không cần hợp nhất tất cả các tệp thành một .Rnw, để gọi \Sexpr{} nói rslts.Rnw?

Các phương pháp khác để thực hiện điều này được hoan nghênh.

Answer 1

Hãy quên một giây rằng bạn đang xử lý Sweave và chỉ nghĩ đến vấn đề mủ cao su - trong đó \include và \includeonly các giải pháp cung cấp. Hãy thử điều đó với một vài tệp thử nghiệm đơn giản.

Một khi bạn đã tìm ra, hãy gấp lại vào hỗn hợp và nó chỉ hoạt động như Sweave sau khi 'đơn thuần' là một bước xử lý trước, mặc dù là một bước rất thông minh.

Answer 2

một câu trả lời khá rõ ràng là sử dụng makefile, có thể sử dụng gói cachesweave, để xử lý các tệp có liên quan theo đúng thứ tự.

Answer 3

Để mở rộng câu trả lời của Dirk và mjm, tôi khuyên bạn nên sử dụng \include và Makefiles.

Giả sử bạn có tệp chính: master.tex. Trong tập tin đó, bạn bao gồm một số .tex và .Rnw file, tức là

\include chapter1 
\include chapter2 
\include chapter3 
.... 

Bây giờ Makefile sau đây cung cấp các chức năng cho việc tạo các .tex, .R và .pdf file:

.SUFFIXES: .tex .pdf .Rnw .R 

MAIN = master 
##List your your .Rnw includes 
RNWINCLUDES = chapter1 chapter2 chapter3 
TEX = $(RNWINCLUDES:=.tex) 
RFILES = $(RNWINCLUDES:=.R) 
RNWFILES = $(INCLUDES:=.Rnw) 

all: $(MAIN).pdf 
    $(MAIN).pdf: $(TEX) $(MAIN).tex 

R: $(RFILES) 

.Rnw.R: 
    R CMD Stangle $< 

.Rnw.tex: 
    R CMD Sweave $< 

.tex.pdf: 
    pdflatex $< 
    bibtex $* 
    pdflatex $< 
    pdflatex $< 

Về cơ bản, .SUFFIXES cung cấp một bộ quy tắc để chuyển đổi từ một định dạng tệp sang định dạng tệp khác. Ví dụ, để chuyển đổi .Rnw-.R, chúng tôi sử dụng lệnh

`R CMD Stangle $<` 

Answer 4

tôi khuyên bạn nên sử dụng RStudio (http://www.rstudio.com/ide/). Sweave được tích hợp độc đáo vào IDE đó và nó hỗ trợ các tài liệu đa tệp. Ngay cả điều hướng nhật ký lỗi Synctex và TeX vẫn hoạt động khi làm việc với tài liệu nhiều tệp.

Từ các tập tin tổng thể, bạn có thể bao gồm các file con sử dụng

\SweaveInput{Child.Rnw} 

Bạn có thể liên kết tập tin một đứa trẻ trở lại các tập tin tổng thể bằng cách bao gồm các chỉ thị

% !Rnw root = Master.Rnw 

trong file đứa trẻ.Bằng cách đó khi làm việc trên một tệp con và sắp xếp nó, RStudio biết để sắp xếp tệp chính.

Các chi tiết được giải thích trong tài liệu RStudio tại http://www.rstudio.com/ide/docs/authoring/multiple_rnw_files