Làm thế nào để sắp xếp các nhóm đường thẳng với nhau?

Question

Tôi có tập tin này:

rs1 1 ADD  0.7  0.75  0.45 
rs1 1 VAR  0.4  4.53  0.06 
rs1 1 USER NA  1.96  0.37 
rs2 2 ADD  1.5  0.25  0.23 
rs2 2 VAR  0.4  4.86  0.03 
rs2 2 USER NA  1.73  0.05 
rs3 3 ADD  0.29 0.76  0.97 
rs3 3 VAR  0.44 3.95  0.09 
rs3 3 USER 0.96 5.41  0.01 

Đối với mỗi giá trị trong $1, có ba dòng với ADD, VAR, USER trong $3. Tôi muốn sắp xếp (sắp xếp ngược lại) tệp dựa trên các giá trị $6 cho các dòng có USER trong $3. Câu hỏi đặt ra là làm thế nào tôi có thể làm điều này và đồng thời giữ các dòng tương ứng với ADD, VAR bên cạnh các dòng được sắp xếp. Tôi không cần hai dòng khác được sắp xếp; Tôi chỉ cần họ ở bên cạnh đường dây sorted.

đầu ra mong muốn:

rs3 3 ADD  0.29 0.76 0.97 
rs3 3 VAR  0.44 3.95 0.09 
rs3 3 USER 0.96 5.41 0.01 
rs2 2 ADD  1.5  0.25 0.23 
rs2 2 VAR  0.4  4.86 0.03 
rs2 2 USER NA  1.73 0.05 
rs1 1 ADD  0.7  0.75 0.45 
rs1 1 VAR  0.4  4.53 0.06 
rs1 1 USER NA  1.96 0.37 

Tôi đã thử mã này, nhưng nó chỉ loại dựa trên $6 giá trị trong USER dòng:

cat File | sort -k1 | uniq | sort -g -k6 > Output 

Cảm ơn bạn

Answer 1

Đây là một chút lộn xộn nhưng làm những gì bạn muốn:

paste - - - < File | sort -k18,18g | xargs -n 6 

Vấn đề với định dạng đầu vào là loại mà không có cách nào để hoạt động trên các nhóm dòng đầu vào, vì vậy bạn cần phải biến từng nhóm thành một dòng, sắp xếp nó, sau đó quay lại. Điều này chỉ hoạt động nếu dòng nhập "USER" luôn nằm trong nhóm.

Answer 2

Dưới đây là một one- lót cho Ruby :)

ruby -e 'File.open(ARGV.shift).readlines.entries.group_by{|e| e.split[1]}.sort.reverse.each{|e| puts e[1]}' file 

Output:

rs3 3 ADD  0.29 0.76  0.97 
rs3 3 VAR  0.44 3.95  0.09 
rs3 3 USER 0.96 5.41  0.05 
rs2 2 ADD  1.5  0.25  0.23 
rs2 2 VAR  0.4  4.86  0.03 
rs2 2 USER NA  1.73  0.01 
rs1 1 ADD  0.7  0.75  0.45 
rs1 1 VAR  0.4  4.53  0.06 
rs1 1 USER NA  1.96  0.37