bioinformatics

8Nhiệt

1Trả lời

Máy phát đệ quy trong Python

Tôi đã viết một hàm để trả về một trình tạo chứa tất cả các kết hợp duy nhất của chuỗi con với độ dài đã cho có chứa nhiều hơn n thành phần từ một chuỗi chính. Như một ví dụ: nếu tôi có 'abcdefghi' và

python recursion generator bioinformatics 2012-04-22

---

5Nhiệt

1Trả lời

Hồ sơ SVM (e1071) trong R

Tôi mới sử dụng R và SVM và tôi đang cố gắng để hồ sơ svm chức năng từ gói e1071. Tuy nhiên, tôi không thể tìm thấy bất kỳ tập dữ liệu lớn nào cho phép tôi có được một phạm vi kết quả hồ sơ tốt thay đ

r statistics machine-learning bioinformatics svm 2012-06-13

---

19Nhiệt

5Trả lời

R trích xuất một phần của chuỗi

Tôi có câu hỏi về việc trích xuất một phần của chuỗi. Ví dụ tôi có một chuỗi như thế này: a <- "DP=26;AN=2;DB=1;AC=1;MQ=56;MZ=0;ST=5:10,7:2;CQ=SYNONYMOUS_CODING;GN=NOC2L;PA=1^1:0.720&2^1:0" tôi cần

r regex string extract bioinformatics 2012-03-15

---

6Nhiệt

1Trả lời

Mô hình Markov ẩn cho xúc xắc ba mặt

Tôi được dạy HMM và đưa ra bài tập về nhà này. Tôi hiểu một phần của nó, nhưng tôi không chắc nó có đúng không. Vấn đề là: Xem xét một trò chơi khác nhau, nơi các đại lý không lật một đồng xu, nhưng t

algorithm probability bioinformatics hidden-markov-models 2011-12-07

---

8Nhiệt

2Trả lời

nơi nào tôi tải xuống dữ liệu biểu hiện gen?

tôi muốn tải xuống dữ liệu biểu hiện gen bắt nguồn từ các thử nghiệm microarray. tôi không biết quá nhiều về chủ đề này, nhưng như tôi hiểu, các hàng thường tương ứng với các gen và các cột tương ứng

download bioinformatics genome 2012-03-23

---

7Nhiệt

3Trả lời

Danh sách phổ biến với bộ dữ liệu

Tôi chỉ đang sử dụng mô phỏng (Mendel's First Law of Inheritance). Trước khi tôi có thể cho các sinh vật giao phối và phân tích kết quả, dân số phải được tạo, tức là danh sách phải được điền với số lư

python bioinformatics rosalind 2013-06-14

---

5Nhiệt

1Trả lời

Cách xóa các hàng có 0 giá trị bằng cách sử dụng R

Xin chào bằng cách sử dụng ma trận biểu hiện gen, số lượng frag để tính toán các gen được biểu hiện khác nhau. Tôi muốn biết làm thế nào để loại bỏ các hàng có giá trị là 0. Sau đó, tập dữ liệu của tô

r bioinformatics 2013-08-05

---

32Nhiệt

3Trả lời

Xóa một phần của chuỗi sau "."

tôi đang làm việc với những con số nhập NCBI tham khảo trình tự như biến a: a <- c("NM_020506.1","NM_020519.1","NM_001030297.2","NM_010281.2","NM_011419.3", "NM_053155.2") Để có được thông tin từ cá

r regex string bioinformatics biomart 2012-05-16

---

11Nhiệt

2Trả lời

Từ điển được lưu trữ hiệu quả. Cấu trúc dữ liệu này có tồn tại không và nó được gọi là gì?

Tôi muốn có cấu trúc dữ liệu lưu trữ nhiều mẩu dữ liệu entropy thấp thường tương tự nhau. Tôi muốn lưu trữ chúng một cách hiệu quả (nén bằng cách nào đó) và lấy ra bằng chỉ mục hoặc khớp. Khôi phục nh

python data-structures bioinformatics 2012-02-18

---

17Nhiệt

6Trả lời

Kiểu từ điển thay thế nhiều mục

Tôi có một data.frame lớn dữ liệu ký tự mà tôi muốn chuyển đổi dựa trên những gì thường được gọi là từ điển bằng các ngôn ngữ khác. Hiện nay tôi đang đi về nó như vậy: foo <- data.frame(snp1 = c("AA",

r dataframe bioinformatics 2011-09-25

---