bioinformatics

5Nhiệt

1Trả lời

Trích xuất thông tin từ Văn bản thuần tuý và Viết sang XML Sử dụng DOM

Hiện tại, tôi đang thiết kế một số công cụ chuyển đổi định dạng trong lĩnh vực glycobiology. Việc chuyển đổi định dạng liên quan đến việc chuyển từ một tệp văn bản sang tệp XML là tiêu chuẩn trong trư

python xml dom bioinformatics 2011-07-07

---

9Nhiệt

7Trả lời

Bạn nghĩ ngôn ngữ nào tốt nhất cho Bioinformatics?

Tôi đã thực hiện một vài công việc nghiên cứu trong Tin học sinh học và tôi đã sử dụng Matlab cho họ. Matlab có rất nhiều công cụ mạnh mẽ và dễ sử dụng. Tôi đã suy nghĩ về trình tự bộ gen và dự đoán c

matlab bioinformatics 2010-06-08

---

9Nhiệt

4Trả lời

Ví dụ về phân loại topo trên các DAG lớn

Tôi đang tìm các ứng dụng thực tế trong đó phân loại topo được thực hiện trên biểu đồ lớn kích cỡ. Một số trường nơi tôi có thể tìm thấy các trường hợp như tin sinh học, độ phân giải phụ thuộc, cơ sở

database dataset bioinformatics directed-acyclic-graphs topological-sort 2011-08-31

---

5Nhiệt

3Trả lời

Trực quan cấu trúc protein

Tôi đã được yêu cầu làm việc về hiển thị cấu trúc protein, giống như RasMol, nơi người dùng sẽ mở tệp pdb để lấy cấu trúc protein. Tôi có thể tạo cấu trúc protein từ tệp pdb như thế nào? Tôi muốn viết

python opengl bioinformatics vtk protein-database 2011-07-22

---

13Nhiệt

6Trả lời

Cách nhanh hơn để chia chuỗi và đếm ký tự bằng R?

Tôi đang tìm cách tính toán nội dung GC cho chuỗi DNA được đọc từ tệp FASTA nhanh hơn. Điều này nhún xuống để lấy một chuỗi và đếm số lần chữ 'G' hoặc 'C' xuất hiện. Tôi cũng muốn chỉ định phạm vi các

optimization string r bioinformatics 2010-03-15

---

7Nhiệt

1Trả lời

Python - Lặp lại trên danh sách lồng nhau

Tôi đang mắc kẹt trên một vấn đề nhỏ nhưng phức tạp kể từ hôm qua. gì tôi có là một (có thể là vô hạn) lồng danh sách như thế này: [1,[2,[3,4]]] or [[1,2],[3,4]] and so on. Trên mỗi mức độ danh sác

python list nested combinatorics bioinformatics 2011-07-27

---

10Nhiệt

4Trả lời

Cuốn sách tin sinh học tốt nhất cho một nhà khoa học máy tính là gì?

Tôi là sinh viên tốt nghiệp CS quan tâm đến nghiên cứu tin sinh học. Tôi không có kinh nghiệm tốt về sinh học. Cuốn sách tin sinh học tốt nhất cho một nhà khoa học máy tính là gì?

computer-science bioinformatics 2010-08-21

---

5Nhiệt

5Trả lời

R tối ưu hóa: Làm cách nào để tránh vòng lặp for trong trường hợp này?

Tôi đang cố gắng thực hiện một giao điểm theo dõi di truyền đơn giản trong R và chạy vào các vấn đề hiệu suất lớn, có thể liên quan đến việc tôi sử dụng các vòng lặp. Trong trường hợp này, tôi có các

optimization r intersection bioinformatics 2010-03-25

---

6Nhiệt

5Trả lời

Thay đổi trục x của số liệu seqlogo trong MATLAB

Tôi đang thực hiện một số lượng lớn seqlogos theo chương trình. Họ là hàng trăm cột rộng và do đó chạy một seqlogo thường tạo ra các chữ cái quá mỏng để xem. Tôi đã nhận thấy rằng tôi chỉ quan tâm đến

java matlab plot bioinformatics 2010-03-26

---

5Nhiệt

5Trả lời

chạy BLAST (bl2seq) mà không cần tạo chuỗi file

Tôi có một kịch bản thực hiện các truy vấn BLAST (bl2seq) Các kịch bản làm việc như thế này: Nhận dãy một, chuỗi b viết chuỗi a đến filea viết chuỗi b đến fileb chạy lệnh 'bl2seq -i filea -j fileb -n

python perl unix shell bioinformatics 2010-02-11

---