hierarchical-clustering

7Nhiệt

4Trả lời

Xây dựng song song ma trận khoảng cách

Tôi làm việc trên phân cụm kết tụ phân cấp trên số lượng lớn vectơ đa chiều, và tôi nhận thấy rằng nút cổ chai lớn nhất là việc xây dựng ma trận khoảng cách. Một thực hiện ngây thơ cho nhiệm vụ này là

python performance parallel-processing distance hierarchical-clustering 2012-06-28

---

9Nhiệt

2Trả lời

Làm cách nào để lấy trọng tâm từ phân cụm kết tụ phân cấp của SciPy?

Tôi đang sử dụng các phương pháp phân cụm kết cấu phân cấp của SciPy để nhóm một ma trận m x n các tính năng, nhưng sau khi phân cụm xong, tôi không thể tìm ra cách lấy trọng tâm từ các cụm kết quả. B

python numpy scipy hierarchical-clustering 2012-02-20

---

6Nhiệt

2Trả lời

lỗi Strange của Hierarchical Clustering trong R

chương trình R của tôi là như sau: hcluster <- function(dmatrix) { imatrix <- NULL hc <- hclust(dist(dmatrix), method="average") for(h in sort(unique(hc$height))) { hc.index <- c(

r cluster-analysis hierarchical-clustering 2012-02-26

---

8Nhiệt

2Trả lời

Duend dendrograms trong r (Đặt dendrograms trở lại trở lại trong r)

Có cách nào khá thẳng về phía trước để đặt hai dendrogram 'trở lại' trong r? Hai dendrogram có chứa các đối tượng giống nhau nhưng được nhóm theo các cách hơi khác nhau. Tôi cần nhấn mạnh cách các chư

r plot ggplot2 hierarchical-clustering dendrogram 2012-09-17

---

13Nhiệt

1Trả lời

Cắt xén dendrogram trong scipy (phân nhóm theo thứ tự)

Tôi có ma trận khoảng cách với khoảng 5000 mục và sử dụng các phương pháp phân cụm theo thứ bậc của nhóm scipy để nhóm ma trận. Code tôi sử dụng cho điều này là đoạn mã sau: Y = fastcluster.linkage(D,

python hierarchical-clustering 2012-04-24

---

14Nhiệt

1Trả lời

làm thế nào để tôi nhận được subtrees của dendrogram do scipy.cluster.hierarchy

tôi đã có một sự nhầm lẫn về module này (scipy.cluster.hierarchy) ... và vẫn có một số! Ví dụ chúng ta có dendrogram sau: Câu hỏi của tôi là làm thế nào tôi có thể trích xuất các subtrees màu (mỗi ngư

python python-2.7 numpy scipy hierarchical-clustering 2013-06-02

---

22Nhiệt

1Trả lời

sự khác biệt trong các giá trị mặc định của bản đồ nhiệt/nhóm trong R (heatplot so với heatmap.2)?

Tôi đang so sánh hai cách tạo bản đồ nhiệt với dendrogram trong R, một với made4 's heatplot và một với gplots của heatmap.2. Các kết quả phù hợp phụ thuộc vào phân tích nhưng tôi đang cố gắng hiểu tạ

r cluster-analysis heatmap hierarchical-clustering bioconductor 2013-07-29

---

17Nhiệt

2Trả lời

Phân cụm dựa trên ma trận khoảng cách

Mục tiêu của tôi là cụm từ dựa trên mức độ tương tự của chúng đối với một tập hợp tài liệu văn bản. Tôi đã tính toán tương tự Jaccard giữa mỗi cặp từ. Nói cách khác, tôi có một ma trận khoảng cách thư

python cluster-computing scikit-learn hierarchical-clustering 2013-04-26

---

7Nhiệt

1Trả lời

Không thể lấy nhóm phân cấp scipy để làm việc

Tôi đã viết một tập lệnh đơn giản nhằm phân cụm theo cấp bậc trên một tập dữ liệu thử nghiệm đơn giản. Tôi đã tìm thấy hàm fclusterdata làm ứng cử viên để nhóm dữ liệu của tôi thành hai cụm. Phải mất

python scipy cluster-analysis hierarchical-clustering 2012-03-26

---

5Nhiệt

1Trả lời

Lỗi với phân cụm theo cấp bậc đa dạng trong R

Tôi đang phân cụm theo cấp bậc với gói R có tên pvclust, được xây dựng trên hclust bằng cách kết hợp bootstrapping để tính mức ý nghĩa cho các cụm thu được. Hãy xem xét các dữ liệu sau thiết lập với 3

r cluster-analysis correlation hierarchical-clustering hclust 2012-10-15

---