bioconductor

5Nhiệt

1Trả lời

GenomicFeatures Trouble Installation Package

Xin lỗi vì đã quay lại sớm như vậy với một câu hỏi cài đặt đơn giản, nhưng không có khả năng tự giải quyết nó làm suy giảm nghiêm trọng năng suất của tôi. Dù sao, tôi đã thử cài đặt GenomicFeatures th

12Nhiệt

3Trả lời

trong R cách nhận thông báo lỗi bằng tiếng Anh

Tôi đang thử một số hướng dẫn về bioconductor; nhưng tôi nhận được thông báo lỗi, mà tôi muốn tìm kiếm/gửi; Thật không may, kể từ khi R được cài đặt trên một hệ thống cấu hình bằng tiếng Pháp, R trả v

5Nhiệt

3Trả lời

Hiển thị tất cả các dòng trong đầu ra gói GenomicRange

Tôi đang làm việc với gói GenomicRange R. Tôi có một tập tin đầu vào như thế này: dvex108056 + 87 206 dvex108056 + 87 226 dvex108056 - 101 240 dvex108056 - 104 240 dvex108056 - 59 188 dvex108056

7Nhiệt

2Trả lời

rpy2: Chuyển đổi một data.frame thành mảng có nhiều mảng

Tôi có một data.frame trong R. Nó chứa rất nhiều dữ liệu: mức biểu hiện gen từ nhiều (125) mảng. Tôi muốn dữ liệu bằng Python, chủ yếu là do sự thiếu năng lực của tôi trong R và thực tế rằng điều này

7Nhiệt

3Trả lời

xử lý tập tin đaFASTA

Tôi tò mò muốn biết liệu có công cụ tin sinh học nào có thể xử lý tệp multiFASTA cho tôi infos như số chuỗi, độ dài, nội dung nucleotide/aminoacid, v.v ... và có thể tự động vẽ các ô mô tả. Cũng là mộ

22Nhiệt

1Trả lời

sự khác biệt trong các giá trị mặc định của bản đồ nhiệt/nhóm trong R (heatplot so với heatmap.2)?

Tôi đang so sánh hai cách tạo bản đồ nhiệt với dendrogram trong R, một với made4 's heatplot và một với gplots của heatmap.2. Các kết quả phù hợp phụ thuộc vào phân tích nhưng tôi đang cố gắng hiểu tạ

7Nhiệt

2Trả lời

tập hợp con của các mẫu cho một đối tượng ExpressionSet

tôi có một đối tượng ExpressionSet với 100 mẫu: > length(sampleNames(eset1)) 100 Tôi cũng có một vector của tên 75 mẫu (không phải là dữ liệu chính nó): > length(vecOf75) 75 Làm cách nào để có t

8Nhiệt

2Trả lời

R + Bioconductor: kết hợp đầu dò trong một ExpressionSet

Trước hết, điều này có thể là Diễn đàn sai cho câu hỏi này, vì nó khá darn R + Bioconductor cụ thể. Đây là những gì tôi có: library('GEOquery') GDS = getGEO('GDS785') cd4T = GDS2eSet(GDS) cd4T <- c